奈良部氏は確か、貧しくて父親の援助を受けていた筈ですが、
当時まだ珍しかった時計を、
しかもカラクリを仕込んで作らせていたとは。
晩年は裕福に暮らしていたのでしょうか。
文学史を揺るがす大発見ですね。

前半は合っていると思うのですが…。

ちょいとゆらぐかなー

単純に？

では、こちら？

数字分からず

こんなところでどうでしょうか?

”さらい”…？

いもてん，であります．
きっと誰かがコレをやる…と，思ったでしょう？

全然わからへん・・・

奈良部 楓の書状

　　秘密問う 足りぬ字さらい 何時と知る
　　（ひみつとうたりぬじさらいいつとしる）

これを上手く並べ替えると何か見えてくるようです。
上手く並べ替えてみると、

　うし　とら　たつ　み　ひつじ　さる　とり　いぬ　い

このように十二支を表す文字でできていたようです。
ここで足りない字は、 ね　う　うま　の三つです。
時計と十二支から、昔用いられていた十二辰刻に当てはめてみると、
一般的には　子…０時、卯…６時、午…１２時　が該当するようです。
ということで３つの数字は、０、６、１２でした。

もう一度見返してみたら1412さんの回答した数字はちょっと違っていたことに気がつきました
まぁ要所はおさえてあるので良しとしましょう

ありがとうございました。

昔用いられていた十二辰刻では、
一般的には　例えば午の刻とは11時から13時の二時間を表しています。

明治時代の人が、単純に
午の刻と12時を同義と捉えるとは考え難いかと。