暗号の解き方、多分分かりました。
でもそうすると、中村君からの手紙の
「Ｈ」は「Ｂ」ではないですかね？

しかし中村君、殺されてしまったんですね。
いつも暗号を解かれてしまうという田中先生が
犯人かとも思いましたが…。

手紙はＨではなくＢでした。ありがとうございます。
中村君は自殺ではないですよね。
その理由は文中からわかるはずです。
ていうか、いまどき切腹って・・。

変換法則は不明ですがユウキさんが犯人でいいですか？苗字が変わった苗字が出てきましたが・・・。

２行目の名前の方は２文字だけでしょうか？何か続きがあるのでしょうか？それとも「氏」や「師」でしょうか？

後は変換法則発見せねば・・・

P.S.Q384に書いた「空き巣きくけこ」は五十音表をなぞれば「イ」になる、ということです。

「ＩＹＷＯＷＫＣＳＤＫ」

それより、どうして自筆の遺書が存在するのかが気になる。

＞ひでぽんさん
仰る通りゆうきさんが犯人です。苗字が変なのは・・・・・。
えーと、２行目の名前は「四」です。
すいません、変換法則というものは無いんです。ただ手紙のＸＫＵＫＷＥＢＫに合わせてとくだけなんです。

＞jabbarさん
書いていませんが遺書は紙に書いてあったんです。偽造する方法はたくさんあると思います。
例えば犯人は先生だったんで・・。

ではヒント？を
手紙にはもうひとつ意味があります。
言ってしまったら瞬殺ですね。

修学旅行があるので正解発表します。
＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊
私はまず自殺ではないと思った。あぐらをかいて切腹のようにすると普通、前に倒れてしまうだが上を向いて後ろに倒れているからだ。
遺書はおそらく中村君の字をなぞって偽造したのだろう。先生なら楽に出来る。（Ｑ３９０から先生とわかる。）
次は犯人を突き止めるため、手紙を解読しなくては。もらった手紙の”ＸＫＵＫＷＥＢＫ”が”なかむら”と書いてあるのではないかと思った。だとしたら、Ｘ＝Ｎ、Ｋ＝Ａ、Ｕ＝Ｋ、Ｗ＝Ｍ、Ｅ＝Ｕ、Ｋ＝Ｒだろう、そして全部が同じ数ずれていることがわかる。つまりＫ＝Ａ、Ｌ＝Ｂ、Ｍ＝Ｃ、Ｎ＝Ｄ、Ｏ＝Ｅ、Ｐ＝Ｆ、Ｑ＝Ｇ、Ｒ＝Ｈ、Ｓ＝Ｉ、Ｔ＝Ｊ、Ｕ＝Ｋ、Ｖ＝Ｌ、Ｗ＝Ｍ、Ｘ＝Ｎ、Ｙ＝Ｏ、Ｚ＝Ｐ、Ａ＝Ｑ、Ｂ＝Ｒ、Ｃ＝Ｓ、Ｄ＝Ｔ、Ｅ＝Ｕ、Ｆ＝Ｖ、Ｇ＝Ｗ、Ｈ＝Ｘ、Ｉ＝Ｙ、Ｊ＝Ｚとなる。
ＩＮＯＵＥ　ＳＩＮで井上　真。
ＫＩＮＴＡＩＴＩ　ＳＩで金田一　四。
ＴＥＫＯＳＩ　ＹＵＵＫＩで梃祇祐樹。
ＭＡＳＩＴＡ　ＹＯＳＩＲＯＵで真下　義郎。
ＳＵＧＩＴＡ　ＹＯＳＩＫＯで杉田　美子。
「祐樹先生が犯人ね。それと・・もう死んだフリしなくていいよ。」「あー、もうわかちゃったかぁ。やっぱりお前なら自殺じゃないと思って調べると思ったんだよね。」
５人の名前の頭文字を拾うと”いきてます”となるのだ。もし警察に通報してたらどうするつもりだったんだろう。